图机器学习(Graph Machine Learning,简称Graph ML)是机器学习的一个分支,专注于利用图形结构的数据。在图形结构中,数据以图的形式表示,其中的节点(或顶点)表示实体,边(或链接)表示实体之间的关系。
本篇文章将从基础开始介绍什么是图,我们如何描述和表示它们,以及它们的属性是什么。
图论是在18世纪由欧拉引入的,用来解决著名的柯尼斯堡大桥问题:是否有可能只穿过七座桥中的每座桥一次。
什么是图?如何定义它?
图就是一组相互连接的对象。
一个图有一组结点N和边E, n是顶点的数目,m是边的数目。连接的两个节点被定义为相邻(节点1相邻或邻接4)。当我们称网络的大小N时,通常指的是节点的数量(链路或边的数量通常称为L)。
有向与无向
图可以是无向图或有向图:
无向图:边是无向的,关系是对称的。画边的顺序并不重要。
有向图:边是有向的(也称为有向图),顶点之间的边可以有方向,可以用箭头表示(也称为弧线)。
图的基本性质
对于一个节点,我们可以将节点度(k)定义为与节点相邻的边,对于一个图,我们可以计算无向图的平均度k:
在有向网络中,定义了一个节点的入度(指指向该节点的边)和出度(指离开该节点的边),节点的总度是两者的和。我们称source节点为没有入度的节点,称sink节点为没有出度的节点。
我们可以计算平均度为:
这里的
邻接矩阵是表示图的另一种方式,其中行和列表示图节点,交集表示一个节点的两个节点之间是否存在链接。邻接矩阵的大小是n x n(顶点数)。如果Aij是节点i和j之间的链接,则Aij为1,否则为0,对于无向图,矩阵是对称的。可以看到在矩阵的对角线上没有1意味着没有自环(节点与自身相连)
对于一个节点i计算一个节点的边(或它的度),沿着行或列求和:
无向图中的总边数是每个节点的度之和(也可以是邻接矩阵中的值之和):
因为在无向图中,你要计算两次边(由于邻接矩阵是对称的,要计算两次相同的边),所以除以2
对于有向图,可以表示两个不同的邻接矩阵,一个表示入度,一个表示出度
对于一个节点,总边数是入度和出度之和:
我们计算一个节点的入度和出度以及总边数:
由于线性代数和图论之间存在联系,所以可以对邻接矩阵应用不同的操作。如果转置一个无向图的邻接矩阵,图是没有改变的因为是对称的,但如果转置一个有向图的邻接矩阵,边则进行了方向的转换。
这些矩阵非常是稀疏的,因为理论上一个节点是可以连接到所有其他节点,但这在现实生活中基本上不会发生。当所有节点都与其他节点相连时,我们称之为完全图。完全图通常用于理解图论中的一些复杂问题(连通性例子等)。
图的最大密度是一个完全图中可能关系的总数。实际密度是测量无向非完全图的密度:
理论上来说在社交网络中,每个人都可以连接到每个人,但这并没有发生。所以最终得到一个70亿行和70亿列的邻接矩阵,其中大多数条目为零(因为非常稀疏)。为什么要说这个呢?因为不是所有的算法都能很好地处理稀疏矩阵。
除了邻接矩阵,我们还可以将图表示为一个边的列表:
但是这种方法对于机器学习分析是有问题的,所以就出现了一种常用的方法:邻接表,因为邻接表对大型和稀疏的节点很有用,它允许快速检索节点的邻居。
加权图
图边还可以增加权值,边并不都是相同的,比如在交通图中,为了选择两个节点之间的最佳路径,我们将考虑表示时间或交通的权重。
自循环
图的节点是可以连接到自己的,所以必须在计算总边数时添加自循环
你也可以有一个多图,一个对节点有多条边
多重图
含有平行边的图称为多重图,或者说一个对节点有多条边
上面就是一些常见的图和表示方式,我们来做一个汇总
图的另一个重要参数是连接性(连通性)。每个节点都能被所有其他节点到达吗?连通图是指所有顶点都可以通过一条路径连接起来的图。不连通图是指有两个或多个连通分量的图
最大的隔离的节点子集被称为“孤岛”(island)。知道图是连通的还是不连通的是很重要的,有些算法很难处理不连通的图。
这可以在邻接矩阵中显示,其中不同的组件被写成对角线块(非零元素被限制在平方矩阵中)。我们称连接两个“孤岛”的链接“桥”(bridge)
如果图很小,这种视觉检查很容易,但对于一个大图,检查连通性是非常有挑战的。
双部图
我们上面所看到的图称为单部图,其中只有一种类型的节点和一种类型的关系
双部图是一种将节点划分为两个不相交集合(通常称为 U 和 V)的图。这些集合是独立的,U 集合中的每个节点都与 V 集合中的某个节点相连(每个链接只能连接一个集合中的节点到另一个集合中的节点)。因此,双部图是一种不存在 U-U 连接和 V-V 连接的图。有许多这样的例子:作者到论文(作者位于 U 集合,并且他们与他们撰写的论文即 V 集合相连)、演员(U)和他们参演的电影(V)、用户和产品、食谱和配料等。另一个例子是疾病网络,其中包括一组疾病和一组基因,只有包含已知会导致或影响该疾病的突变的基因才与该疾病相连。另一个例子是匹配,双部图可用于约会应用程序。对于一个有两组节点的双部图(U 有 m 个节点,V 有 n 个节点),可能的边的总数是 m*n,节点的总数是 m + n。
双部图可以折叠成两个单独的网络,U 的投影和 V 的投影。在 U 的投影中,如果两个节点连接到同一个 V 节点,则它们相连(V 投影的原理相同)。
如果需要,我们也可以构建一个三部图。总的来说,你可以拥有超过三种类型的节点,通常我们讲的是 k-部图。这种类型的图扩展了我们对双部图的看法。
异构图
异构图(也称异质图)是一种具有不同类型的节点和边的图。
平面图
如果一幅图可以绘制成没有任何边相交的形式(对于图来说,如果可以以这种方式绘制,它被称为平面表示),则可以将其视为平面图。即使绘制时边相交,图也可以是平面的。看这个例子,这幅图可以重新绘制成平面表示。
为什么知道我们是否可以有平面表示很有用?最常用的一个例子是绘制电路版,要保证电路不会相交。
循环图与非循环图
线路 (walk) 是节点的交替序列(u-v 的线路是从 u 开始并在 v 结束的节点序列)。路径(path)是序列中节点各不相同的线路(u-x-v 是一条路径,但 u-x-u-x-v 是线路但不是路径)。循环图是路径开始和结束于同一节点的图,因为不同的算法都有循环问题(所以有时需要通过切断一些连接将循环图转换为非循环图)。我们可以将前馈神经网络定义为有向无环图(DAG),因为DAG 总是有一个结束点(也称为叶子节点)。
总结
在本文中,我们介绍了什么是图及其主要属性,尽管图看起来很简单,但可以实现无限的变化。图是节点和边的集合;它没有顺序,没有开始也没有结束。我们可以通过它们定义不同类型的概念和数据。图还可以简洁地描述数据的许多属性,并为我们提供关于不同主题之间关系的信息。例如,我们可以为节点和边分配权重和属性。在以后的文章中,我们将讨论如何在这些网络中使用算法(以及如何表示它们)。
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